Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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