Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms