Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms