Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms