Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgm3Q08189 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms