Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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