Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms