Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc2Q05020 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms