Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nf1Q04690 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms