Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms