Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax5Q02650 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms