Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms