Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms