Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SelpQ01102 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SelpQ01102 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SelpQ01102 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SelpQ01102 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SelpQ01102 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SelpQ01102 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms