Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nbr1P97432 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms