Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx1P80205 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx1P80205 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx1P80205 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx1P80205 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Otx1P80205 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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