Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
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Tp53bp1P70399 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Tp53bp1P70399 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Tp53bp1P70399 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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