Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chl1P70232 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chl1P70232 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chl1P70232 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chl1P70232 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chl1P70232 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chl1P70232 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chl1P70232 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chl1P70232 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Chl1P70232 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chl1P70232 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chl1P70232 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chl1P70232 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chl1P70232 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chl1P70232 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chl1P70232 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms