Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Cldn18P56857 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
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