Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd38P56528 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd38P56528 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd38P56528 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd38P56528 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd38P56528 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd38P56528 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd38P56528 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd38P56528 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cd38P56528 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms