Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Sh3bp1P55194 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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