Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
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PtpreP49446 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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PtpreP49446 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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PtpreP49446 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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PtpreP49446 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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PtpreP49446 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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PtpreP49446 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtpreP49446 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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PtpreP49446 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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PtpreP49446 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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PtpreP49446 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
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PtpreP49446 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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PtpreP49446 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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PtpreP49446 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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PtpreP49446 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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PtpreP49446 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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PtpreP49446 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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PtpreP49446 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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PtpreP49446 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpreP49446 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms