Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TgfaP48030 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TgfaP48030 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TgfaP48030 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TgfaP48030 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfaP48030 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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