Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd4P46935 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms