Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
PtgfrP43117 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms