Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sept1P42209 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sept1P42209 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sept1P42209 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sept1P42209 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sept1P42209 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sept1P42209 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sept1P42209 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sept1P42209 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sept1P42209 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sept1P42209 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sept1P42209 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms