Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms