Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rom1P32958 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rom1P32958 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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