Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Saa4P31532 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Saa4P31532 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Saa4P31532 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Saa4P31532 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Saa4P31532 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Saa4P31532 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Saa4P31532 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Saa4P31532 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Saa4P31532 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms