Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 1500004A13Rik-201ENSMUST00000183374 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm38006-201ENSMUST00000192421 697 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Olfr861-ps1-201ENSMUST00000212783 928 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Olfr926-201ENSMUST00000078289 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Gm43747-201ENSMUST00000201412 1330 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Gm17727-201ENSMUST00000171898 643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Gm18748-201ENSMUST00000198507 622 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Tas2r141-ps4-201ENSMUST00000205072 946 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Olfr190-201ENSMUST00000071243 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Olfr873-202ENSMUST00000075717 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxa2P31245 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms