Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxraP28700 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxraP28700 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxraP28700 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxraP28700 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxraP28700 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxraP28700 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxraP28700 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxraP28700 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxraP28700 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RxraP28700 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxraP28700 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxraP28700 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxraP28700 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxraP28700 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxraP28700 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxraP28700 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxraP28700 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxraP28700 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxraP28700 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RxraP28700 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RxraP28700 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RxraP28700 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RxraP28700 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RxraP28700 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RxraP28700 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RxraP28700 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
RxraP28700 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RxraP28700 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RxraP28700 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RxraP28700 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RxraP28700 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RxraP28700 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
RxraP28700 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RxraP28700 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
RxraP28700 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
RxraP28700 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RxraP28700 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms