Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BgnP28653 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BgnP28653 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BgnP28653 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
BgnP28653 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BgnP28653 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BgnP28653 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BgnP28653 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BgnP28653 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BgnP28653 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BgnP28653 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BgnP28653 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BgnP28653 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
BgnP28653 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BgnP28653 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BgnP28653 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
BgnP28653 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BgnP28653 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BgnP28653 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BgnP28653 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BgnP28653 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BgnP28653 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
BgnP28653 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
BgnP28653 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BgnP28653 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BgnP28653 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
BgnP28653 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
BgnP28653 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
BgnP28653 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
BgnP28653 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
BgnP28653 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
BgnP28653 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
BgnP28653 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
BgnP28653 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BgnP28653 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
BgnP28653 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
BgnP28653 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
BgnP28653 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BgnP28653 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
BgnP28653 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BgnP28653 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BgnP28653 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BgnP28653 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BgnP28653 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
BgnP28653 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
BgnP28653 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
BgnP28653 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BgnP28653 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BgnP28653 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BgnP28653 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BgnP28653 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BgnP28653 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BgnP28653 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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