Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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