Protein–RNA interactions for Protein: P20863

Gdf1, Embryonic growth/differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf1P20863 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf1P20863 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms