Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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PdgfaP20033 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PdgfaP20033 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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