Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NelfeP19426 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NelfeP19426 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NelfeP19426 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NelfeP19426 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
NelfeP19426 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NelfeP19426 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
NelfeP19426 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NelfeP19426 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NelfeP19426 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
NelfeP19426 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NelfeP19426 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NelfeP19426 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NelfeP19426 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
NelfeP19426 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NelfeP19426 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NelfeP19426 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NelfeP19426 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NelfeP19426 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
NelfeP19426 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NelfeP19426 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
NelfeP19426 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
NelfeP19426 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
NelfeP19426 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
NelfeP19426 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
NelfeP19426 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NelfeP19426 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
NelfeP19426 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NelfeP19426 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
NelfeP19426 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
NelfeP19426 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
NelfeP19426 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
NelfeP19426 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
NelfeP19426 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
NelfeP19426 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NelfeP19426 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NelfeP19426 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
NelfeP19426 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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NelfeP19426 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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NelfeP19426 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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NelfeP19426 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NelfeP19426 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NelfeP19426 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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