Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhoP15409 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RhoP15409 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhoP15409 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhoP15409 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhoP15409 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhoP15409 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhoP15409 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RhoP15409 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhoP15409 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhoP15409 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhoP15409 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhoP15409 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhoP15409 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhoP15409 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RhoP15409 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhoP15409 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhoP15409 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhoP15409 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RhoP15409 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RhoP15409 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhoP15409 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhoP15409 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RhoP15409 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhoP15409 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
RhoP15409 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RhoP15409 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RhoP15409 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhoP15409 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhoP15409 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RhoP15409 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhoP15409 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RhoP15409 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhoP15409 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhoP15409 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhoP15409 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhoP15409 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhoP15409 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhoP15409 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhoP15409 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhoP15409 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhoP15409 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RhoP15409 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhoP15409 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhoP15409 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhoP15409 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RhoP15409 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhoP15409 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhoP15409 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
RhoP15409 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhoP15409 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RhoP15409 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhoP15409 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RhoP15409 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RhoP15409 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhoP15409 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhoP15409 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RhoP15409 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhoP15409 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhoP15409 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhoP15409 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhoP15409 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RhoP15409 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhoP15409 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhoP15409 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhoP15409 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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RhoP15409 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhoP15409 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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RhoP15409 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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RhoP15409 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhoP15409 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhoP15409 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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RhoP15409 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RhoP15409 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhoP15409 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhoP15409 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhoP15409 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhoP15409 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhoP15409 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhoP15409 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RhoP15409 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhoP15409 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhoP15409 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhoP15409 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhoP15409 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhoP15409 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhoP15409 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhoP15409 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhoP15409 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhoP15409 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhoP15409 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhoP15409 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhoP15409 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms