Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DmdP11531 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DmdP11531 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DmdP11531 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DmdP11531 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DmdP11531 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DmdP11531 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DmdP11531 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DmdP11531 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DmdP11531 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DmdP11531 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DmdP11531 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DmdP11531 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DmdP11531 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DmdP11531 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DmdP11531 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DmdP11531 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DmdP11531 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DmdP11531 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DmdP11531 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
DmdP11531 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DmdP11531 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DmdP11531 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DmdP11531 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DmdP11531 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DmdP11531 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DmdP11531 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DmdP11531 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DmdP11531 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DmdP11531 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DmdP11531 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DmdP11531 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DmdP11531 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DmdP11531 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DmdP11531 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DmdP11531 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DmdP11531 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DmdP11531 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DmdP11531 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DmdP11531 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DmdP11531 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DmdP11531 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DmdP11531 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
DmdP11531 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DmdP11531 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
DmdP11531 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DmdP11531 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DmdP11531 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DmdP11531 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DmdP11531 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DmdP11531 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DmdP11531 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DmdP11531 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
DmdP11531 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DmdP11531 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DmdP11531 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DmdP11531 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
DmdP11531 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
DmdP11531 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DmdP11531 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DmdP11531 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DmdP11531 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DmdP11531 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DmdP11531 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DmdP11531 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DmdP11531 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DmdP11531 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DmdP11531 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DmdP11531 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DmdP11531 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DmdP11531 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DmdP11531 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
DmdP11531 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DmdP11531 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
DmdP11531 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DmdP11531 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DmdP11531 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DmdP11531 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DmdP11531 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DmdP11531 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DmdP11531 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DmdP11531 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DmdP11531 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DmdP11531 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DmdP11531 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DmdP11531 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DmdP11531 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DmdP11531 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DmdP11531 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
DmdP11531 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DmdP11531 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DmdP11531 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DmdP11531 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DmdP11531 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DmdP11531 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
DmdP11531 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
DmdP11531 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DmdP11531 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DmdP11531 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DmdP11531 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms