Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cxcl2P10889 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cxcl2P10889 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cxcl2P10889 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cxcl2P10889 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cxcl2P10889 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cxcl2P10889 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cxcl2P10889 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cxcl2P10889 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cxcl2P10889 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cxcl2P10889 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cxcl2P10889 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cxcl2P10889 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cxcl2P10889 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cxcl2P10889 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cxcl2P10889 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cxcl2P10889 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cxcl2P10889 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cxcl2P10889 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cxcl2P10889 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cxcl2P10889 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cxcl2P10889 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cxcl2P10889 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cxcl2P10889 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cxcl2P10889 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cxcl2P10889 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cxcl2P10889 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cxcl2P10889 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cxcl2P10889 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cxcl2P10889 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cxcl2P10889 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cxcl2P10889 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cxcl2P10889 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cxcl2P10889 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cxcl2P10889 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cxcl2P10889 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms