Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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