Protein–RNA interactions for Protein: P0C7A0

Khdc1b, KH homology domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1bP0C7A0 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Khdc1bP0C7A0 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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