Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms