Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms