Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spta1P08032 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spta1P08032 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spta1P08032 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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