Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfrbP05622 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms