Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms