Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa7P02830 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms