Protein–RNA interactions for Protein: O88574

Sap30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30O88574 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Sap30O88574 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Sap30O88574 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Sap30O88574 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Sap30O88574 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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