Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Copb2O55029 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Copb2O55029 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Copb2O55029 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Copb2O55029 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Copb2O55029 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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Copb2O55029 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Copb2O55029 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Copb2O55029 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Copb2O55029 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Copb2O55029 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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