Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TsksO54887 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TsksO54887 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TsksO54887 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TsksO54887 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TsksO54887 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TsksO54887 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TsksO54887 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TsksO54887 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TsksO54887 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TsksO54887 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TsksO54887 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TsksO54887 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TsksO54887 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TsksO54887 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TsksO54887 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TsksO54887 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TsksO54887 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TsksO54887 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TsksO54887 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TsksO54887 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TsksO54887 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TsksO54887 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TsksO54887 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TsksO54887 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TsksO54887 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TsksO54887 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TsksO54887 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TsksO54887 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TsksO54887 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TsksO54887 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TsksO54887 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TsksO54887 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TsksO54887 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TsksO54887 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TsksO54887 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TsksO54887 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TsksO54887 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TsksO54887 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TsksO54887 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TsksO54887 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TsksO54887 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TsksO54887 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TsksO54887 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TsksO54887 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TsksO54887 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TsksO54887 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TsksO54887 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TsksO54887 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TsksO54887 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TsksO54887 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TsksO54887 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TsksO54887 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TsksO54887 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TsksO54887 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TsksO54887 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TsksO54887 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TsksO54887 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TsksO54887 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TsksO54887 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TsksO54887 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TsksO54887 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TsksO54887 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TsksO54887 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TsksO54887 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TsksO54887 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TsksO54887 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TsksO54887 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TsksO54887 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TsksO54887 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TsksO54887 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TsksO54887 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TsksO54887 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TsksO54887 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TsksO54887 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TsksO54887 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TsksO54887 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TsksO54887 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TsksO54887 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TsksO54887 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TsksO54887 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TsksO54887 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TsksO54887 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TsksO54887 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TsksO54887 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TsksO54887 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TsksO54887 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TsksO54887 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TsksO54887 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TsksO54887 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TsksO54887 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TsksO54887 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TsksO54887 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TsksO54887 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TsksO54887 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TsksO54887 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TsksO54887 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TsksO54887 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TsksO54887 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TsksO54887 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms